구조 이성질체는 동일한 분자식을 가진 물질이지만, 원자들의 연결 방식이나 구조가 다른 것을 의미한다. 이성질체는 일반적으로 두 가지 주요 유형으로 분류된다: 구조적 이성질체(type I)와 입체 이성질체(type II).

구조적 이성질체는 원자의 연결 순서가 다르며, 이는 각각의 화합물의 물리적 및 화학적 성질에 차이를 초래할 수 있다. 이러한 이성질체는 다시 여러 가지 하위 유형으로 나눌 수 있다. 예를 들어, 알킬 그룹의 분자 내 위치가 다르거나, 결합 방식이 달라질 경우에 각각의 구조적 이성질체가 형성된다.

구조적 이성질체는 일반적으로 물질의 끓는점, 녹는점, 밀도 등과 같은 물리적 성질에서 뚜렷한 차이를 보인다. 이들은 또한 화학적 반응성이나 생리학적 활성이 다를 수 있어, 화학 합성이나 생물학적 과정에서 중요한 역할을 한다.

따라서 구조 이성질체는 화학 연구 및 응용에서 중요한 개념으로, 다양한 물질의 특성과 반응 메커니즘을 이해하는 데 기여한다. 이성질체는 또한 의약 화학에서 약물의 설계와 개발에 필수적인 요소로 작용하기도 한다.